Jean Calvin

Andreae var teolog og underviste i kristne læresetninger

Andreas bestefar, Jacob Andreae, var professor i teologi og var rektor for universitetet i Tübingen. Som sønn av en smed, ble han kalt Luther av Würtemberg, og han var også sjefs-rammemaker for konkordieformelen i 1577. Som Andreaes far, var også Johann en lutheransk prest, men ser ut som hadde neglisjert både sin familie og sin prestegjerning for å følge sine interesser innen alkymi. Etter hans fars død i 1601, flyttet Andreaes mor. Maria Moser Andreae familien til Tübingen. Hun var også svært interessert i naturstudier, og i sine senere år, ble hun tilsatt i stillingen som hoff-apoteker.

Som følge av sin dårlige helse som barn, fikk Johann Valentin sin første skoleundervisning hjemme. Under påvirkning av sin far, og ved å følge tradisjonene på den tiden, ble han introdusert for omfattende og vidtrekkende studier av klassiske forfattere, og naturhemmeligheter. Allerede før han startet ved Tübingen universitetet i 1601, utviste han allerede en stor interesse for astronomi, matematikk, mekanikk, musikk og kunstmaling, og han leste allerede nå, Josephus, Livy og Erasmus, såvel som Sebastian Münsters "Cosmographia". Han forfulgte disse interessene under universitetsstudiene, hvor han fant et intellektuelt miljø, ikke ulikt det Kepler hadde kommet inn i 1589 karakterisert av Lutheransk ortodoksi på den ene siden, og naturens bok og naturens mysterier, på den andre. Andreae var ferdig bachelor i 1603 og mastergraden var gjort unna i 1605. Deretter tok han offisielt opp teologistudiet, uten av i avkall på sine tidligere interesser. Som følge av at han hadde deltatt i noen studentsaker som hadde brutt noen universitetsreguleringer, ble han utvist i 1607, og han startet nå en femårs periode, med utstrakt reising, bare avbrutt av noen perioder hvor han bodde og studerte i Tübingen, hvor han også tok seg arbeid som privatlærer og veileder. 

Blandt de lærerne som spesifikt utøvde en stor innvirkning på Andreae, var to spesielle som også hadde undervist den kjente matematikeren Johannes Kepler, sammen med blant andre som: teologen Matthias Hafenreffer, og matematikeren Michael Mästlin. I tillegg til disse, sto han i en kraftig gjeld til en annen kjenning av Kepler, Christoph Besold, som selv om hans emne var rettsvitenskap, tok han all sin kunnskap fra hans provins. Besold snakket mange språk, inkludert hebraisk og mest sannsynlig også arabisk. På denne måten, kunne Besold også lese middelalder-filosofi, renessanse-humanistene, og de tyske mystikerne fra senere middelalder. Han beundret Paracelsus, Ramón Lull, Nicholas av Cusa, og Pico della Mirandola. Det var av stor betydning for Andreae, og få gjøre nytte av Besolds omfattende bibliotek. Godt forberedt i forskjellige språk under Besolds veiledning, reiste Andreae rundt i Tyskland, Frankrike, Nord-Spania, Østerrike, Italia og Sveits. Tidlig i 1611, besøkte han Lausanne og Genève, hvis en Calvinistisk sosialorganisasjon, imponerte ham stort, og det var her han unnfanget ideen og ønsket om, å introdusere noe lignende i sin egen kirke. Ett år senere, reiste han til Roma gjennom Nord-Italia, hvor han besøkte noen platoniske akademier. Han opplevde Roma som fremmed for sin egen natur og egen personlighet, at han beste seg for å vie sitt liv til den lutheranske teologien, og til gudstjenestene i hans kirke.