Mens mange syriske prelater fulgte denne nytenkende innovatøren, ble han fordømt i Alexandria i 321 av hans bispedømmer, av en synode med nesten hundre egyptiske og libyske biskoper. Fratatt sin stilling og ekskommunisert, flyktet «kjetteren» til Palestina. Her henvendte han seg med en helt uforsvarlig uttalelse eller prinsipperklæring til Eusebius av Nicomedia, som allikevel ble hans livslange mester, som selve hadde oppnådd aktelse hos keiser Konstantin, med hans verdslige prestasjoner. I hans hus, huset til den «forbudte» mannen, var han alltid rede til å skrive, komponert i vers og prosa, til forsvar for hans posisjon, som han termilogiserte som «Thalia». Noen få fragmenter fra disse, overlevde. Det er også blitt sagt at, Arius også komponerte og publisert sanger til sjømenn, møllere og reisende, hvor i disse, hans trosbekjennelse ble illustrert.

Høyt over det vanlige, tynn, asketisk og alvorlig, har Arius blitt avbildet med livlige farger av Ephifanius (kjetterier 69,3) men hans moralske karakter ble aldri anklaget, bortsett fra et tvilsomt angrep av ærgjerrighet av Theodoret. Han må ha vært i en relativ høy alder, når han, etter en fruktløs forhandling og besøk til Egypt, dukket opp i kirkemøtet I Nicæa i 325, hvor den trosbekjennelse han presenterte, ble revet i stykker. Med hans skrifter og følgere, gjennomgikk han en voldsom motstand, fra mer enn, tre hundre biskoper. Han ble bannlyst og forvist til Illyricum. To prelater led den samme skjebne; Tehonas av Marmarica, og Secundus av Ptolemais. Arius sine bøker, ble brent. Arianerne, sammen med deres gamle melitianske venner, fortsatte å skape problemer i Alexandria. Eusebius overtalte keiser Konstantin til, å tilbakekalle Arius` eksil, med overbærende brev i 328. Konstantin tillot ikke bare Arius` tilbakekomst til Alexandria i 331, men beordret også Athanasius til å forsone ham med kirken. På helgenens avslag av dette, fulgte mer forstyrrelser. Den fullsatte og partisaniske synoden i Tyrus avsatte Athanasius på en rekke fåfengte anklager i 325. Katolikker ble nå forfulgt. Arius hadde et intervju med keiser Konstantin, og leverte en trosbekjennelse, som keiseren dømte til å bli ortodoks. Med en keiserlig reskript, krevde Arius at, Alexander av Konstantinopel skulle gi ham nattverd. Men som et slag fra forsynet, ødela dette forsøket, som katolikkene så som helligbrøde. «Kjetteren» døde plutselig, og ble begravd av sitt eget folk.

Arius hadde vinnende oppførsel, en unnvikende stil og et omstridt temperament. Men i striden som er kalt etter navnet hans, regnet Arius bare i begynnelsen. Han representerte ikke tradisjonen til Alexandria, men de aktuelle finessene i Antiokia. Derfor stoppet hans forsvinning fra åstedet verken striden eller avsluttet krangelen, som han overilet hadde provosert. Som partiteolog viste han ingen trekk av geni; han var produktet, ikke grunnleggeren, av en skole.  

Arius av Alexandria, ble av pavekirken i Roma, ansett som en kjetter, ja nærmest, selve hovedkjetteren av alle kjettere (250-336) Det er antatt at, han var av Libysk opprinnelse. Arius fars navn, tror man var Ammonius.

I 306, hvor Arius hadde lært sitt religiøse syn fra presbyteren Lucian fra Antiokia, som senere ble en martyr, tok side med den egyptiske skismatikeren Meletius i synet mot Peter, biskopen av Alexandria. Men de fikk i stand en forsoning, og biskop Peter, ordinerte Arius til diakon.

Lengre og videre disputter, førte til at biskopen ekskommuniserte den rastløse kirkemannen. Men Arius oppnådde imidlertid et vennskap Achillas, Peters etterfølger som biskop, hvor han ordinerte Arius som presbyter i 313, med ansvaret for et velkjent distrikt i Alexandria kalt Baucalis. Dette gjorde at, Arius kunne gjøre krav på, å få utdype skriftene offisielt, og han utøvde stor innflytelse, når han i 318, kranglet med biskop Alexander over den fundamentale sannheten om Jesus Kristus` guddommelige sønnskap og substans (starten på arianismen).